如何在 Ubuntu 20.04 上安装 R

介绍

R 是一种开源编程语言,广泛用于执行数据分析和统计计算。在 R 统计计算基金会的支持下,它是一种日益流行且可扩展的语言,社区活跃。R 为特定研究领域提供了许多用户生成的包,这使其适用于许多领域。

在本教程中,我们将安装 R 并展示如何从官方综合 R 存档网络 (CRAN)添加包

先决条件

要学习本教程,您需要一个 Ubuntu 20.04 服务器,其中包含:

  • 至少1GB 的内存
  • 具有sudo特权的非 root 用户

要了解如何实现此设置,请遵循我们的初始服务器设置指南

一旦这些先决条件到位,您就可以开始了。

第 1 步 – 安装 R

由于 R 是一个快速发展的项目,因此 Ubuntu 的存储库并不总是提供最新的稳定版本,因此我们将从添加 CRAN 维护的外部存储库开始。

注意: CRAN 在其网络内维护存储库,但并非所有外部存储库都是可靠的。确保仅从受信任的来源安装。

让我们先添加相关的 GPG 密钥。

  • sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9

当我们运行命令时,我们将收到以下输出:

Output
Executing: /tmp/apt-key-gpghome.cul0ddtmN1/gpg.1.sh --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9 gpg: key 51716619E084DAB9: public key "Michael Rutter <[email protected]>" imported gpg: Total number processed: 1 gpg: imported: 1

一旦我们有了可信密钥,我们就可以添加存储库。

请注意,如果您不使用 20.04,您可以从R 项目 Ubuntu 列表中找到相关存储库,以每个版本命名。Ubuntu 20.04 被称为 Focal Fossa,R 的最新版本是 4.0.0,因此下面的存储库命名约定 – focal-cran40.

  • sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/'

在显示的输出中,您应该识别出类似于以下内容的行:

Output
... Get:7 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ InRelease [3622 B] Get:8 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ Packages [15.6 kB] ...

现在,我们需要update在此之后运行以包含来自新存储库的包清单。

  • sudo apt update

确保其中一行输出类似于以下内容:

Output
... Hit:5 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ InRelease ...

如果上面的行出现在update命令的输出中,我们已经成功添加了存储库。我们可以确定我们不会意外安装旧版本。

此时,我们已准备好使用以下命令安装 R。

  • sudo apt install r-base

如果提示确认安装,请按y继续。

在撰写本文时,来自 CRAN 的最新稳定版 R 是 4.0.1,在您启动 R 时显示。

由于我们计划为系统上的每个用户安装一个示例包,我们将以 root 身份启动 R,以便所有用户都可以自动使用这些库。或者,如果您在R没有 的情况下运行命令sudo,则可以为您的用户设置个人库。

  • sudo -i R
Output
R version 4.0.0 (2020-04-24) -- "Arbor Day" Copyright (C) 2020 The R Foundation for Statistical Computing Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) ... Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. >

这确认我们已经成功安装了 R 并进入了它的交互式 shell。

步骤 2 — 从 CRAN 安装 R 包

R 的部分优势在于其可用的大量附加包。出于演示目的,我们将安装txtplot,这是一个输出 ASCII 图形的库,包括散点图、折线图、密度图、acf 和条形图:

  • install.packages('txtplot')

注意:以下输出显示了软件包的安装位置。

Output
... Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’ (as ‘lib’ is unspecified) ...

这个站点范围的路径是可用的,因为我们以 root 身份运行 R。此位置将使所有用户都可以使用该包。

安装完成后,我们可以加载txtplot

  • library('txtplot')

如果没有错误消息,则库已成功加载。现在让我们通过一个示例来将其付诸实践,该示例演示了带有轴标签的基本绘图功能。由 R 的datasets提供的示例数据包含基于 1920 年代数据的汽车速度和停止所需的距离

  • txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = 'speed', ylab = 'distance')
Output
+----+-----------+------------+-----------+-----------+--+ 120 + * + | | d 100 + * + i | * * | s 80 + * * + t | * * * * | a 60 + * * * * * + n | * * * * * | c 40 + * * * * * * * + e | * * * * * * * | 20 + * * * * * + | * * * | 0 +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+ 5 10 15 20 25 speed

如果您有兴趣了解有关 的更多信息txtplot,请help(txtplot)在 R 解释器中使用。

任何预编译包都可以从 CRAN 安装install.packages()要了解有关可用内容的更多信息,您可以通过可用的 CRAN 包按名称列表找到按名称组织的官方包列表

要退出 R,您可以键入q()您可以n在出现提示时,除非您想保存工作区图像。

结论

在您的服务器上成功安装 R 后,您可能会对安装 RStudio 服务器以将 IDE 引入您刚刚完成的基于服务器的部署的本指南感兴趣您还可以学习如何设置Shiny 服务器以将您的 R 代码转换为交互式网页。

有关如何利用不同工具安装 R 包的更多信息,您可以阅读有关如何直接从 GitHub、BitBucket 或其他位置安装的信息这将使您能够利用活跃社区的最新工作。

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